哈医学以阴阳学作为理论基础，运用阴阳学说，解释和说明人体的生理功能、解剖、病理变化、病因病机、药物性味，并指导临床诊断和治疗。如哈医认为人体每个脏器器宫都有其阴阳属性，外在十二器官如毛孔、皮肤、耳、舌、眼、鼻等为阳，而内在的十二脏器如肺、脑、心、腺体（淋巴）、骨、肝等为阴，阳性器官也有阳中之阴，阴性脏器也有阴中之阳。 学习哈医学，要掌握独特的诊断方法，主要包括望、嗅、听和问、触、切。医者通过望诊，全面观察病人的形、态、神、色等；凭嗅觉器官嗅病人身上的异常气味：凭听觉听异常声音；用切按脉搏和病变部位；仔细询问病情发生的时间地点和发展情况、现在的症状和与疾病有关的病史。另外，学生还要熟悉哈医学常用的500多种药物，以及独特的治疗方法，如药浴、蒸薰洗疗法、放血疗法、羊油疗法等。